Hagoromo racconta del suo passato: dopo la battaglia contro Kaguya, viaggia per il mondo con lo scopo di riparare i danni causati dalla lotta contro i Cercoteri.

Naruto e Sasuke sono impegnati nella battaglia per fermare Kaguya, ma nonostante le tecniche più disparare, non riescono nell'intento.

Hagoromo termina il suo allenamento mentre arriva un rospo messaggero che informa Gamamaru che Kaguya è tornata e che non sono riusciti a contattare Hamura.

I figli di Kaguya, Hagoromo e Hamura, vengono attirati attraverso uno stratagemma al cospetto di Gamamaru, un rospo, che li ha vuole incontrare.

Zetsu comincia il racconto attraverso i suoi ricordi mostra che Kaguya venne dal cielo e venne trovata dagli uomini del regno di So e venne portata al cospetto del loro re Tenji al quale rivelo il suo nome Kaguya venne ospitata in quel luogo diventando amica di Aino sua ancella.

Il chakra delle persone di tutto il mondo viene incanalato attraverso le radici dell'albero divino e assorbito da Madara. La puntata finisce in cui torna in vita la madre di Hagoromo Otsutsuki: KAGUYA.

Mentre la luce dello Tsukuyomi infinito si affievolisce, termina anche il ricordo del fratello Itachi da parte di Sasuke. Zetsu Nero tradisce Madara.

 Itachi, Sasori e Kisame vengono inviati da Pain a chiedere a Deidara di unirsi all'Organizzazione Alba. Il giorno dopo Itachi, Konan e Kakuzu vengono inviati sempre da Pain a chiedere a Hiden di unirsi all'Organizzazione Alba per essere il rimpiazzo dell'ex compagno di squadra di Kakuzu.

Juzu, un ex membro dei Sette Spadaccini della Nebbia soppravissuto all'attacco del padre di Gai, e Itachi discutono brevemente delle loro specialità prima di compiere una speciale: catturare Yagura, il Quarto Mizukage, nonché la forza portante di Isobu (Tricoda).

Mentre Naruto e Sasuke sono intrappolati all'interno dello Tsukuyomi Infinito, quest'ultimo ricorda il fratello Itachi quando egli uccide l'intero clan Uchiha ad eccezione di Sasuke.

Fugaku parla a Itachi dello Sharingan. Itachi è arrabbiato perché a suo padre non importa che Tenma Izumo sia morto.

Itachi gioca con il piccolo Sasuke e ripensa a una delle sue missioni: si ricorda del giorno in cui, dopo aver condiviso dei dolcetti con Izumi, era stato incaricato da Nonna Gatta di trovare un gatto ninja, insieme a Shinko, Tenma e Yuuki. Tenma era personalmente coinvolto nel portare a termine la missione, poiché i baffi di quel gatto erano l'ingrediente di una medicina per il padre malato. Il gatto ninja riusciva a sfuggire ai suoi inseguitori, ma alla fine è proprio Itachi a catturarlo. Ripensando a quella missione e all'amicizia nata con il suo compagno di squadra, si rattrista, perché poco dopo Tenma era stato ucciso durante un altro incarico. Il dolore risveglia lo Sharingan di Itachi, e il piccolo Sasuke lo nota.

La Volpe a Nove Code attacca il Villaggio della Foglia e, durante lo scontro, muoiono sia la madre che il padre di Naruto. Approfittando della fase di ricostruzione, vengono ridefiniti alcuni confini del paese e il clan Uchiha, assieme al corpo di polizia, nonostante il malcontento generale, saranno costretti a trasferirsi in una zona periferica. Nel frattempo, Itachi inizia a frequentare l'Accademia, ma si rivela presto uno studente molto brillante che eccelle in tutte le materie e che è già in grado di padroneggiare tecniche proibite. Per questo motivo, gli insegnati e il corpo docenti, valutano la possibilità di farlo diplomare in anticipo rendendolo così un ninja a tutti gli effetti.

 Itachi è testimone degli orrori della guerra. Sasuke rivive anche i momenti in cui Mikoto, sua madre, ha detto a Itachi che sarebbe diventato un fratello maggiore. Il suo "fratellone" si è sempre preso cura di lui, ma una notte sente un vento minaccioso.

Sasuke accetta di tornare al Villaggio, ma rifiuta di far parte della squadra dei suoi vecchi compagni.