Venuti a conoscenza dei poteri dei Zetsu bianchi tramite Shikaku (che a sua volta aveva ricevuto notizie da Sakura e Shizune), Naruto e Bee li affrontano e sconfiggono grazie alle nuova abilità di Naruto. 

Naruto chiede al Raikage di revocare la condanna a morte di Sasuke arrivando persino a supplicarlo, ma quest'ultimo si rifiuta. Mentre Sasuke ed il suo gruppo si introducono nella fortezza, il Summit ha inizio. Il Raikage accusa gli altri paesi di aver contribuito alla fondazione dell'Organizzazione Alba o di essersene serviti in passato. La tensione cresce causando addirittura l'intervento delle guardie del corpo dei Kage che si ritirano non appena viene ristabilita la calma. Concordato che sia necessario nominare un leader dell'alleanza, Mifune, in quanto rappresentante dei paesi neutrali, propone di eleggere Danzo che si compiace di come tutto stia andando secondo i suoi piani.

I cinque Kage partono dai rispettivi villaggi, ognuno accompagnato da due guardie del corpo. Sulla strada verso il Summit, Danzo viene attaccato da un gruppo di ninja. Dopo aver istruito le sue guardie del corpo di non interferire, l'Hokage si scopre l'occhio destro, rivelando uno Sharingan nascosto, ed elimina facilmente gli assalitori. Kakashi scopre che gli ANBU stanno spiando Naruto, perciò chiede a Sai di non informare Danzo sulle sue intenzioni mentre egli si mette all'inseguimento, assieme a Yamato ed allo stesso Naruto, del Team Samui. Zetsu guida Sasuke ed il suo team al Paese del Ferro, luogo dove si terrà il Summit, una terra ghiacciata difesa da samurai invece che da ninja. Naruto, Kakashi e Yamato raggiungono il Team Samui ed il Raikage ed il ragazzo si appresta a chiedere la revoca della condanna a morte di Sasuke.

Assorbendo il potere della torre che si era creata, il clone si trasforma in una versione ad otto teste ed uccide Disonasu. Naruto, dopo esser stato colpito, riesce, grazie alla voce di Minato, a creare un mantello di chakra con l'immagine della volpe con 6 code. Non riuscendo però a sconfiggere il clone, Naruto è costretto a farsi dominare dalla Volpe, che assume la forma a 7 code e viene affrontata da Yamato. Kakashi intanto era impegnato nello scontro con Kabuto e Deidara, che lasciano il campo di battaglia usando un diversivo. Dokku e Shiseru invece andando a disattivare la fonte di potere, si confessano il loro amore, ma Shiseru rischia di cadere, con Dokku che la teneva con una mano, proprio come vari anni prima. Miina riesce a far tornare Naruto al controllo, così il ninja di Konoha, attivando una forma simile a quella che attiverà con l'allenamento insieme a Bee, salva la donna usando la sua velocità. Dokku, ricordando la melodia di Miina, disattiva il Saezuri, mentre Naruto usa i suoi nuovi poteri per fermare il clone della volpe. Alla fine dell'episodio i bambini festeggiano con Naruto, esausto.

Le rivelazioni di Tobi e Zetsu spronano Sasuke a porsi come obiettivo l'assassinio di Danzo durante il summit. Al villaggio della Foglia, Karui, preoccupata per il suo maestro, interroga Naruto nel tentativo di avere notizie su Sasuke, ma Naruto si rifiuta di aiutarla. Adirata, Karui attacca Naruto, ma viene fermata da Sai. Naruto informa Kakashi e Yamato di voler chiedere al Raikage ed a Danzo di riconsiderare la loro condanna nei confronti di Sasuke. I due Jonin, dopo un'iniziale riluttanza, si convincono quando Naruto racconta loro del suo incontro col padre e decidono di accompagnarlo al luogo dove si svolgerà il summit.

A seguito dello stato comatoso di Tsunade, Danzo viene nominato Hokage e, come primo atto ufficiale, condanna Sasuke a morte in quanto traditore, cosa che sciocca Naruto e Sakura. Omoi, Karui e Samui arrivano al villaggio e consegnano la convocazione al summit dei cinque Kage a Danzo. Karui ed Omoi si confrontano con Naruto e Sakura nel tentativo di avere notizie su Sasuke, ma i ninja della Foglia non li aiutano non riuscendo ad accettare il fatto che il loro ex-compagno sia diventato un criminale. Intanto, Tobi e Zetsu informano Sasuke e la sua squadra dell'inganno di Killer Bee, della distruzione del Villaggio della Foglia e del summit al quale parteciperà Danzo in quanto nuovo Hokage.

Kabuto é uno degli antagonisti principali del manga, inizialmente presentato come genin di Konoha. É un ninja medico, ex braccio destro di Orochimaru ed è stato una delle spie di Sasori della Sabbia Rossa su ordine di Orochimaru. Dopo la morte di Orochimaru, Kabuto si trapianta le cellule di quest'ultimo e si unisce all'Akatsuki, capitanata da Tobi, durante la 4ª guerra mondiale ninja, sfruttando in battaglia la tecnica della Resurrezione Impura e svelando la sua capacità di entrare in modalità eremitica. Durante lo scontro con Itachi e Sasuke scopriamo che era un orfano di guerra e fu trovato da Nonou Yakushi, passò la sua infanzia all'orfanotrofio di Konoha e dopo 3 anni venne preso dalla radice come spia, per poi unirsi ad Orochimaru.

Mentre si dirige verso il Villaggio della Foglia assieme al suo team, Sasuke riporta alla mente alcuni eventi del passato. Poco dopo lo scontro fra Gaara e Naruto, Sasuke aveva salvato la vita ad una ragazzina di nome Naho e quest'ultima si era innamorata di lui. Naruto e Sakura vennero incaricati di scortare Naho al Villaggio Shizume mentre Sasuke e Kakashi si occupavano di alcuni nemici che il duo scoprì essere stati incaricati di rapire Naho. Naruto e Sakura vennero presi in ostaggio, ma Sasuke li liberò e sconfisse il capo dei banditi infierendo su di lui per sfogare la sua frustrazione nei confronti della forza crescente di Naruto. In quel momento, tutti notarono il primo passo verso le tenebre di Sasuke.

Notando l'ottima coordinazione con Choji ed Ino, Shikamaru ricorda una missione durante la quale il Team 10 ed il Team 7 hanno collaborato per salvare degli ostaggi. Aiutati da un ex bandito, i ninja della Foglia arrivano al nascondiglio dei rapitori dove l'uomo li mette in guardia da Baji, il loro capo. Shikamaru escogita un piano che consiste nel mandare i Jonin in avanscoperta. L'ex bandito viene catturato e, all'insaputa dei ninja della Foglia, si rivela essere una spia. Shikamaru si offre come ostaggio in cambio della liberazione dell'uomo. Grazie alla coordinazione con il resto del gruppo, Shikamaru viene liberato ed i banditi sconfitti.

Naruto e Sakura, vedendo Kiba ed Akamaru lavorare insieme, ricordano un momento del loro passato. Il Team 7 viene incaricato di recuperare un tesoro rubato. Uno dei ladri utilizza su Sasuke e Naruto una tecnica che li lega assieme mentre Sakura viene catturata. Naruto e Sasuke decidono di recuperare Sakura e, nonostante le iniziali difficoltà nel lavorare assieme, riescono a trovare i ladri ed a sconfiggerli. Naruto, Sasuke e Sakura recuperano il tesoro mentre Kakashi osserva come il successo della loro missione sia dipeso dal non lasciare indietro la propria compagna.

Naruto, vedendo una foto trovata tra le macerie di Konoha, ricorda un avvenimento accaduto anni prima. Mentre correva tra le montagne, cade in un burrone dove trova un sigillo e, sbadatamente, lo toglie; tale sigillo non si rivela essere altro che un'anima sigillata di un ANBU di Konoha, dal nome Kisuke. Naruto è l'unico che, dopo aver tolto il sigillo, può interagire con l'anima liberata sotto forma di fantasma. Il ragazzo, viste le amnesie dell'innoquo fantasma, decide di aiutare a liberare il suo spirito poiché una leggenda narra che un fantasma rimane intrappolato nella vita terrena in quanto è desideroso di sbrigare delle faccende che non ha mai potuto risolvere quando era in vita. Grazie all'aiuto di Sakura, scoprono che il corpo di Kisuke è ancora in vita; perciò, si recano alla casa del padrone grazie all'indirizzo ricevuto dall'ospedale ed è lì che il fantasma recupera la memoria: era un ANBU incaricato di sorvegliare le spie di Konoha; tra questi, c'era anche un famoso stratega, chiamato Sabiru, il quale aveva proposto, alla riunione dei maggiori esponenti del Villaggio della Foglia, un piano di sicurezza, di propria ideazione, in modo da avere, così, pieno controllo su Konoha. Ed è stato lo stesso Sabiru a sigillare l'anima di Kisuke ed ad uccidere il corpo dell'ANBU in ospedale per non avere nessun intoppo nel suo piano. Ma, è dopo aver discusso con Naruto, Kakashi ed anche con l'anima di Kisuke che Sabiru confessa di aver ucciso la famiglia dell'ormai ex-ANBU; Sabiru viene catturato mentre Konoha non è più in pericolo, ora, finalmente, l'anima di Kisuke può andare nell'aldilà dove ritroverà la moglie, amante dei tulipani. Si tratta proprio degli stessi fiori che Naruto, puntualmente, in ricordo della vicenda vissuta, porta, con grande emozione, sulla tomba dei due sposi.

Dokku, venendo a conoscenza dell'accordo tra Disonasu e Kabuto, prova ad attaccarlo ma viene facilmente fermato. Disonasu inoltre si complimenta con Naruto per aver sconfitto Pain, che tempo prima l'aveva lasciato senza poteri. I ninja della Foglia e Shiseru si muovono velocemente per arrivare alla Buca ma Kabuto, usando un clone, era riuscito a prendere l'ultimo pezzo per usare Saezuri, che viene attivato poco dopo con un suono simile a quello che lei usava suonare. Kakashi arriva poco dopo e rivela il passato di Disonasu, alleato di Orochimaru, ma Kabuto evoca Deidara, Hidan e il clone della volpe, che affronterà Naruto, liberatosi usando la modalità eremitica. Shikamaru affronta Hidan, che era stato immobilizzato e si dissolve a causa della corta vita dei serpenti nel suo corpo. La puntata si conclude vedendo il potere dell'obelisco creato dall'attivazione di Saezuri.

Il team di Konohamaru chiede a Neji di parlare loro dell'eroismo di Naruto. Neji racconta una storia accaduta anni prima durante l'esame di selezione dei Chunin. Dopo la distruzione del Villaggio della Foglia da parte di Orochimaru, due ninja del Villaggio della Nuvola rapiscono Hinata per ottenere i segreti del Byakugan. Al loro inseguimento si recano Neji, Kiba e Tenten, i quali, grazie all'astuzia di Neji, riescono a portare in salvo la compagna. Quando Neji cade in una trappola magica, Hiashi Hyuuga, capo del clan e padre di Hinata, accorre in suo aiuto e sistema definitivamente il ninja della Nuvola. Il Team Konohamaru si chiede che ruolo abbia avuto Naruto in questa storia, ma Neji fornisce loro una risposta criptica sapendo in cuor suo che, senza le parole di Naruto durante il loro match nelle finali dell'esame di selezione dei Chunin, egli non si sarebbe comportato in maniera così generosa ed eroica.

Una donna ninja di nome Hanare, spia del Villaggio della Chiave, viene catturata dagli ANBU della Foglia e portata nelle camere segrete del villaggio per l'interrogatorio. Inizialmente, Inoichi non riesce ad estrarre informazioni dalla ragazza e, così, Kakashi viene incaricato di carpire i segreti della spia col suo Sharingan. L'Hokage, ritenendo che la donna non sappia niente, decide di barattarla con un Jonin della Foglia. Mentre lo scambio ha luogo, Kakashi si rende conto che la ragazza nasconde qualcosa e tenta di catturarla nuovamente, ma ella riesce a scappare. Una volta raggiunta da Kakashi, Hanare confessa di essersi resa conto, durante il suo periodo alla Foglia, di tutte le cose belle alle quali ha dovuto rinunciare facendo la spia e decide di cancellare dalla sua mente i segreti appresi sul villaggio avversario. Kakashi capisce il suo gesto e decide di lasciarla andare

Il clone della Volpe prova ad attaccare Dokku, che viene salvato da Gai e Rock-Lee. Successivamente arrivano i vecchi compagni di Naruto, che affrontano i resuscitati, mentre Kakashi affronta Kabuto. La Volpe intanto si libera per poter assorbire il chakra da Naruto, ancora incosciente, cresce di dimensione e inizia a distruggere il villaggio Hacho. Dokku prova a salvare Naruto ma entrambi vengono presi da Kabuto, che ha usato dei serpenti capaci di assorbire il chakra per fermare Naruto. Nel frattempo Shiseru pensa ad una precedente conversazione con Dokku, durante la quale pensano se adottare o no i bambini. Leo e gli altri bambini, invece, convinti di poter salvare il maestro, danno a Kabuto l'ultimo pezzo di Saezuri, e ciò permette a Disonasu, che rivela di essere un traditore, di evocare, tramite un rotolo, Saezuri.